Génotypage MH (Gène Culard) : Chez les bovins, la présence du caractère dit « culard », se traduit par des modifications importantes de conformation et de composition de la carcasse. Les caractéristiques de la viande sont elles aussi modifiées mais de façon variable suivant les muscles. La prédisposition d’un bovin à posséder une double musculature vient de l’absence au niveau des cellules musculaires d’un facteur de croissance appelé lamyostatine. Neuf mutations différentes peuvent provoquer une protéine tronquée ou non fonctionnelle donc inactive ce qui entraîne un phénotype culard.
Dépistage de la beta-mannosidase : La β-mannosidose est une maladie lysosomiale provoquée par un déficit en β-mannosidase. Cette maladie provoque de graves troubles neurodégénératifs chez l’Homme, les Caprins et les Bovins. En France, cette maladietouche plus particulièrement la race Salers. Un test génétique permet de dépister les animaux porteurs de l’anomalie génétique. Les veaux atteints ne survivent pas la période néonatale.
Dépistage du Free Martinisme : Le freemartinisme est une anomalie fréquente chez les bovins lors de naissances gémellaires hétérosexuées. Il se traduit par une stérilité de la femelle due à un développement anormal de son système reproducteur. La technique de PCR est une technique de choix du diagnostic du freemartinisme en raison de sa rapidité, de sa sensibilité et de sa spécificité.
Huitres : Dépistages de Pathogènes : Suite à la hausse de mortalité d'huitres creuses survenue au cours de l'été 2008, l'IFREMER a transféré à Genindexe la technologie pour dépister 3 Pathogènes susceptibles d'être impliqués dans ces mortalités. Genindexe propose également le dépistage d'un pathogène supplémentaire. Ces tests de dépistages sont tous réalisés par la technique de PCR en temps réel. + Infos
Poissons :
Aquaculture : Dans le cadre d'un partenariat avec l'IFREMER, GENINDEXE réalise des études de diversité génétique sur des populations de poissons comme les ombrines ou les saumons. Le laboratoire tente actuellement de mettre en place des analyses pour le Turbot, la Truite Arc en ciel, le Bar et la Dorade.
Plats cuisinés à base de poisson : GENINDEXE est désormais capable de déterminer si un plat cuisiné contient uniquement l'aliment indiqué sur l'emballage. Ce test est actuellement disponible pour les plats à base de Morue et de Noix de Saint Jacques mais GENINDEXE est à votre entière disposition pour le mettre au point sur d'autres plats cuisinés.
Porcins : Test "Halothane": Des marqueurs d'ADN sont utilisés pour détecter les gènes déficients ou non désirables et écarter de la ligne de reproduction les animaux qui en sont porteurs. L'industrie porcine a ainsi pu réduire l'incidence du syndrome de sensibilité au stress et le nombre des naissances de bêtes dont la viande laisse à désirer parce qu'elle est pâle, flasque, imbibée d'eau et qu'elle durcit lors de l'abattage. Ces deux tares sont causées par un même gène : le gène HAL de sensibilité à l'halothane, aujourd'hui identifié comme étant le gène du récepteur à la ryanodine (ryr1). L'analyse de ce gène par des techniques de biologie moléculaire permet de déterminer le génotype d'un individu. Les différents génotypes rencontrés sont importants pour la sélection des animaux reproducteurs. En effet, les qualités organoleptiques de la viande peuvent varier en fonction de ce caractère génétique. Les test "halothane" permet la détection des mutations dans le gène ryr1 et donc la détermination du génotype de l'individu testé.
Test RN : Découvert en 1986, le gène RN a un effet important sur le rendement à la cuisson de la viande de porc. Son effet considérable sur le potentiel glycolytique musculaire et donc le pH ultime à la viande est aujourd'hui bien établi. Genindexe détecte les mutations dans le gène RN chez les porcins au niveau des codons 199 et 200.
· En un seul prélèvement, 3 analyses sont possibles : HAL, RN et possibilité de combiner avec un caryotype. · Résultats: 2 semaines à réception des échantillons.
Gazelles : Etude de consanguinité et constitution d'un arbre généalogique. Girafes : Etude de consanguinité et étude phylogénétique. Perdrix : Etude d'hybridation entre perdrix rouge et perdrix choukar. Saumons atlantique : Étude de diversité génétique. Truites Fario : Étude d'identification de la provenance de truites (entre la souche sauvage et piscicole) en partenariat avec l'Université de Montpellier. Crevettes : Identification des différentes souches utilisées en crevéticulture.
GENINDEXE poursuit actuellement ses recherches sur d'autres animaux. Si vous avez des besoins particuliers sur des epèces déjà étudiées ou qui ne le sont pas encore, n'hésitez pas à nous contacter!
Genindexe 2007 - Laboratoire d'Analyses Génétiques - 6 rue des sports - 17000 LA ROCHELLE - Tél: 05.46.30.69.66